Cellprofilerを用いた共局在解析

GFPとRFPの共局在を数値化する必要があったので、CellProfilerを用いて解析することに。 MeasureColocalizationを用いて解析しようとしたが処理が激重。1枚に1分かかる。 計算する数値を絞ることに。 今回測定したいものは、細胞質に偏在しているタンパク質…

YeastRGBについて

YeastRGBについての覚書 PMC6324022 イスラエルのEmmanuel等が作成した酵母ORFの蛍光写真データーベース セルグリッド形式で細胞の蛍光写真像(60x)が並べてある。 蛍光タンパク質は従来のN末に付いているコレクションに加えSWAT法(後述)でN及びC末端に付…

プラスミドを入れ間違える

光らないプラスミドを入れたつもりの酵母光ってしまった。明日入れ直そう。

酵母のゲノムインテグレーション

酵母ゲノムへの形質転換はプラスミドのそれと比較して相当に効率が悪い。 酵母ゲノムを大規模に改変して合成酵母を作り出すSC2.0というプロジェクトでは、高効率な形質転換法が必要であろうと思われるので、それを参考にしてみたいと思う。 science.sciencem…

卒論

直前であくせくするのも嫌なので卒論に着手することにした。 卒論のテーマはコロナ明けから始めた実験なのでそれほど大変なこともなかろう楽観視していたが、これがなかなか大変だ。 要は自分の実験を筋に沿って並べるだけなのだが、生来の気性ゆえにデータ…